Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF4Q15306 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF4Q15306 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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