Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPAQ15257 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPAQ15257 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms