Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PRKD1Q15139 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKD1Q15139 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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