Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCF4Q15080 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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NCF4Q15080 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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NCF4Q15080 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NCF4Q15080 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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