Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERC3Q15034 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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