Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFIXQ14938 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NFIXQ14938 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NFIXQ14938 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms