Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRCAPQ14761 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRCAPQ14761 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms