Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IRF3Q14653 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
IRF3Q14653 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms