Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EFR3AQ14156 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFR3AQ14156 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms