Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COL9A2Q14055 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COL9A2Q14055 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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