Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EXOSC2Q13868 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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