Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCIRG1Q13488 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TCIRG1Q13488 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCIRG1Q13488 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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