Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TOP3AQ13472 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOP3AQ13472 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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