Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLN3Q13286 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CLN3Q13286 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CLN3Q13286 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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