Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR5A1Q13285 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR5A1Q13285 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR5A1Q13285 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR5A1Q13285 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR5A1Q13285 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR5A1Q13285 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR5A1Q13285 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR5A1Q13285 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR5A1Q13285 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR5A1Q13285 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR5A1Q13285 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR5A1Q13285 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR5A1Q13285 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR5A1Q13285 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NR5A1Q13285 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR5A1Q13285 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms