Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGDRQ13258 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGDRQ13258 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGDRQ13258 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGDRQ13258 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTGDRQ13258 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTGDRQ13258 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGDRQ13258 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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