Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACACAQ13085 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACACAQ13085 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms