Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MKRN3Q13064 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN3Q13064 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN3Q13064 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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