Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFX1Q12986 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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