Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BNIP1Q12981 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BNIP1Q12981 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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