Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TROQ12816 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TROQ12816 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TROQ12816 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TROQ12816 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TROQ12816 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
TROQ12816 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
TROQ12816 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
TROQ12816 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TROQ12816 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TROQ12816 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TROQ12816 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TROQ12816 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TROQ12816 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TROQ12816 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TROQ12816 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TROQ12816 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TROQ12816 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TROQ12816 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TROQ12816 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TROQ12816 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TROQ12816 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TROQ12816 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TROQ12816 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TROQ12816 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TROQ12816 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TROQ12816 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TROQ12816 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TROQ12816 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TROQ12816 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TROQ12816 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TROQ12816 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TROQ12816 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TROQ12816 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TROQ12816 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TROQ12816 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TROQ12816 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TROQ12816 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TROQ12816 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TROQ12816 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TROQ12816 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TROQ12816 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
TROQ12816 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TROQ12816 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TROQ12816 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TROQ12816 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TROQ12816 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TROQ12816 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
TROQ12816 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TROQ12816 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TROQ12816 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
TROQ12816 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TROQ12816 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TROQ12816 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
TROQ12816 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TROQ12816 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TROQ12816 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TROQ12816 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TROQ12816 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TROQ12816 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
TROQ12816 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TROQ12816 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TROQ12816 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TROQ12816 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TROQ12816 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TROQ12816 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TROQ12816 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TROQ12816 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TROQ12816 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TROQ12816 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TROQ12816 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TROQ12816 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TROQ12816 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TROQ12816 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TROQ12816 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TROQ12816 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TROQ12816 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TROQ12816 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TROQ12816 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TROQ12816 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TROQ12816 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TROQ12816 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TROQ12816 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TROQ12816 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TROQ12816 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TROQ12816 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TROQ12816 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TROQ12816 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TROQ12816 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TROQ12816 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TROQ12816 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TROQ12816 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TROQ12816 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TROQ12816 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TROQ12816 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TROQ12816 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TROQ12816 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
TROQ12816 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TROQ12816 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TROQ12816 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
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