Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFEMP1Q12805 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EFEMP1Q12805 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
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