Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXO1Q12778 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXO1Q12778 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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