Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NUP160Q12769 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NUP160Q12769 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NUP160Q12769 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NUP160Q12769 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
NUP160Q12769 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
NUP160Q12769 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NUP160Q12769 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NUP160Q12769 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NUP160Q12769 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NUP160Q12769 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NUP160Q12769 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NUP160Q12769 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NUP160Q12769 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NUP160Q12769 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NUP160Q12769 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
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