Protein–RNA interactions for Protein: Q12159

YRA1, RNA annealing protein YRA1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRA1Q12159 COP1YDL145C 3606 nt3.7□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 DEG1YFL001W 1329 nt3.7□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 SEN1YLR430W 6696 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 CWC2YDL209C 1020 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 YDL228CYDL228C 642 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 RPS13YDR064W 456 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 MIC26YGR235C 702 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 YLR156WYLR156W 345 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 YLR159WYLR159W 345 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 YLR161WYLR161W 345 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 YBL029WYBL029W 1131 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 MRPL3YMR024W 1173 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 RPL18BYNL301C 561 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 RPL18AYOL120C 561 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 HSP82YPL240C 2130 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 MET16YPR167C 786 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 ARR1YPR199C 885 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 GEM1YAL048C 1989 nt3.69□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 TAF7YMR227C 1773 nt3.68□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 APL4YPR029C 2499 nt3.68□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 XKS1YGR194C 1803 nt3.68□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 NTA1YJR062C 1374 nt3.68□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 FMP10YER182W 735 nt3.68□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 RNA1YMR235C 1224 nt3.68□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 YPR059CYPR059C 387 nt3.68□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 MET17YLR303W 1335 nt3.68□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 MCD4YKL165C 2760 nt3.68□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 TRS85YDR108W 2097 nt3.67□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 KRE29YER038C 1395 nt3.67□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 UBP10YNL186W 2379 nt3.67□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 GRS2YPR081C 1857 nt3.67□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 RTA1YGR213C 954 nt3.67□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 ERG20YJL167W 1059 nt3.67□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 YJR038CYJR038C 363 nt3.67□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 ELF1YKL160W 438 nt3.67□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 PER33YLR064W 822 nt3.67□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 RSA3YLR221C 663 nt3.67□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 YML053CYML053C 639 nt3.67□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 YNL143CYNL143C 393 nt3.67□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.67□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 PDR12YPL058C 4536 nt3.67□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 GAS2YLR343W 1668 nt3.66□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 RKM3YBR030W 1659 nt3.66□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 YRM1YOR172W 2361 nt3.66□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 YGL262WYGL262W 528 nt3.66□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 MRS3YJL133W 945 nt3.66□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 ARG80YMR042W 534 nt3.66□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 PUF2YPR042C 3228 nt3.66□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 YRB30YGL164C 1323 nt3.66□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 MIH1YMR036C 1665 nt3.65□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 PMC1YGL006W 3522 nt3.65□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 GPB1YOR371C 2694 nt3.65□□□□□ -1.82
YRA1Q12159 HSP30YCR021C 999 nt3.65□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 snR7-LsnR7-L 214 nt3.65□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 CAF16YFL028C 870 nt3.65□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 PRX1YBL064C 786 nt3.65□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 POC4YPL144W 447 nt3.65□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 YPL162CYPL162C 822 nt3.65□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 ALG5YPL227C 1005 nt3.65□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 ISA2YPR067W 558 nt3.65□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 FLO10YKR102W 3510 nt3.65□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 KRE5YOR336W 4098 nt3.65□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 EMP47YFL048C 1338 nt3.65□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 TDA1YMR291W 1761 nt3.64□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 NOP6YDL213C 678 nt3.64□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 YGL214WYGL214W 486 nt3.64□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 SOL4YGR248W 768 nt3.64□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 PHA2YNL316C 1005 nt3.64□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 MST1YKL194C 1389 nt3.63□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 KIP3YGL216W 2418 nt3.63□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 SVF1YDR346C 1446 nt3.63□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 ELO2YCR034W 1044 nt3.63□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 YDR282CYDR282C 1245 nt3.63□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 RPB7YDR404C 516 nt3.63□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.63□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 YOL153CYOL153C 1746 nt3.62□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 SEC2YNL272C 2280 nt3.62□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 MMT1YMR177W 1533 nt3.62□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 YDL094CYDL094C 510 nt3.62□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 AI5_BETAQ0075 1065 nt3.62□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 YHI9YHR029C 885 nt3.62□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 CMR3YPR013C 954 nt3.62□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 EFM2YBR271W 1260 nt3.62□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 ERB1YMR049C 2424 nt3.62□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 UPC2YDR213W 2742 nt3.62□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 SMF1YOL122C 1728 nt3.61□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 RIA1YNL163C 3333 nt3.61□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 SPC19YDR201W 498 nt3.61□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 IRC22YEL001C 678 nt3.61□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 YEL028WYEL028W 462 nt3.61□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 LSB1YGR136W 726 nt3.61□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 DAN1YJR150C 897 nt3.61□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 REX4YOL080C 870 nt3.61□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 TCM62YBR044C 1719 nt3.61□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 SEG1YMR086W 2883 nt3.61□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 TRF5YNL299W 1929 nt3.6□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 NUS1YDL193W 1128 nt3.6□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.6□□□□□ -1.83
YRA1Q12159 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.8 ms