Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 SUP35YDR172W 2058 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 YDL027CYDL027C 1263 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 COS12YGL263W 1143 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 PRE9YGR135W 777 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 YUH1YJR099W 711 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 YKL023WYKL023W 834 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 MIM2YLR099W-A 264 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 YLR169WYLR169W 354 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 NEJ1YLR265C 1029 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 RPS10BYMR230W 318 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 MDJ2YNL328C 441 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 YPL168WYPL168W 1293 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 YJL206CYJL206C 2277 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 MDM10YAL010C 1482 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 PEX29YDR479C 1665 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 THI20YOL055C 1656 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 SYF1YDR416W 2580 nt5.05□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 RVB1YDR190C 1392 nt5.04□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 HRK1YOR267C 2280 nt5.04□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 COX3Q0275 810 nt5.04□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 SAW1YAL027W 786 nt5.04□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 AAD10YJR155W 867 nt5.04□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 MTD1YKR080W 963 nt5.04□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 RPF2YKR081C 1035 nt5.04□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.04□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 EOS1YNL080C 1101 nt5.04□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 YBL096CYBL096C 309 nt5.04□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 YPR142CYPR142C 564 nt5.04□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 URC2YDR520C 2319 nt5.04□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 TEC1YBR083W 1461 nt5.04□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 TRM44YPL030W 1704 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 RCK2YLR248W 1833 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 YCR015CYCR015C 954 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 SPT3YDR392W 1014 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 TFB3YDR460W 966 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 YEL067CYEL067C 588 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 MRP4YHL004W 1185 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 ARC19YKL013C 516 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 NMA1YLR328W 1206 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 POP8YBL018C 402 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 MRPS17YMR188C 714 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 SSU72YNL222W 621 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 MCK1YNL307C 1128 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 PRM1YNL279W 1986 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 PRP28YDR243C 1767 nt5.03□□□□□ -1.6
SLX4Q12098 KAR2YJL034W 2049 nt5.02□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 SWI3YJL176C 2478 nt5.02□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 YDL124WYDL124W 939 nt5.02□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 FMC1YIL098C 468 nt5.02□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 SLZ1YNL196C 897 nt5.02□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 YOR342CYOR342C 960 nt5.02□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 snR37snR37 386 nt5.02□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 PRP9YDL030W 1593 nt5.02□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 SAT4YCR008W 1812 nt5.02□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 RAD30YDR419W 1899 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 AUA1YFL010W-A 285 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 SUT1YGL162W 900 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 YIL025CYIL025C 375 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 YOR314WYOR314W 330 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 snR17bsnR17b 332 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 APC4YDR118W 1959 nt5.01□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 RTC5YOR118W 1704 nt5□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 CTT1YGR088W 1689 nt5□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 SHU2YDR078C 672 nt5□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 NBP2YDR162C 711 nt5□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 SAP30YMR263W 606 nt5□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 SPS2YDR522C 1509 nt5□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 PTR3YFR029W 2037 nt5□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 SSB2YNL209W 1842 nt5□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 YMR196WYMR196W 3267 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 TRE2YOR256C 2430 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 SWP82YFL049W 1872 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 TAF12YDR145W 1620 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 MIC26YGR235C 702 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 COS8YHL048W 1146 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 HTA2YBL003C 399 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 AIF1YNR074C 1137 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 CDC28YBR160W 897 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 DNF2YDR093W 4839 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 GIP4YAL031C 2283 nt4.99□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 YCR007CYCR007C 720 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 RRN9YMR270C 1098 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 IBD2YNL164C 1056 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 YOL118CYOL118C 309 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 YOL162WYOL162W 648 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 YOR114WYOR114W 885 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 SMP3YOR149C 1551 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 TIF4632YGL049C 2745 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 YPL260WYPL260W 1656 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 MEF1YLR069C 2286 nt4.98□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 RIM21YNL294C 1602 nt4.97□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 PGM2YMR105C 1710 nt4.97□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 ALR2YFL050C 2577 nt4.97□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 GLO3YER122C 1482 nt4.97□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 ARF2YDL137W 546 nt4.97□□□□□ -1.61
SLX4Q12098 GIC2YDR309C 1152 nt4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.7 ms