Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZGT2

NEXN, Nexilin, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXNQ0ZGT2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEXNQ0ZGT2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEXNQ0ZGT2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEXNQ0ZGT2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEXNQ0ZGT2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEXNQ0ZGT2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEXNQ0ZGT2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEXNQ0ZGT2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEXNQ0ZGT2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEXNQ0ZGT2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEXNQ0ZGT2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NEXNQ0ZGT2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEXNQ0ZGT2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEXNQ0ZGT2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEXNQ0ZGT2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEXNQ0ZGT2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms