Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CGNL1Q0VF96 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CGNL1Q0VF96 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CGNL1Q0VF96 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms