Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C2orf54Q08AI8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms