Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE4CQ08493 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms