Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHRNB3Q05901 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms