Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIN1Q05586 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIN1Q05586 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIN1Q05586 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms