Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCZQ05513 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCZQ05513 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms