Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE3AQ05086 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3AQ05086 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms