Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSBP1Q04837 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms