Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TAP1Q03518 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAP1Q03518 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms