Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAV1Q03135 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAV1Q03135 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAV1Q03135 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAV1Q03135 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAV1Q03135 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAV1Q03135 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAV1Q03135 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAV1Q03135 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV1Q03135 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV1Q03135 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV1Q03135 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV1Q03135 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV1Q03135 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV1Q03135 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV1Q03135 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV1Q03135 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV1Q03135 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV1Q03135 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAV1Q03135 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms