Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL6Q02878 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL6Q02878 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms