Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP4Q02446 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP4Q02446 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP4Q02446 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP4Q02446 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP4Q02446 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP4Q02446 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP4Q02446 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP4Q02446 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SP4Q02446 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SP4Q02446 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SP4Q02446 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SP4Q02446 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SP4Q02446 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SP4Q02446 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP4Q02446 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP4Q02446 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP4Q02446 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP4Q02446 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP4Q02446 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP4Q02446 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP4Q02446 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP4Q02446 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP4Q02446 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP4Q02446 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP4Q02446 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP4Q02446 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP4Q02446 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SP4Q02446 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP4Q02446 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SP4Q02446 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SP4Q02446 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP4Q02446 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP4Q02446 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP4Q02446 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP4Q02446 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP4Q02446 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP4Q02446 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP4Q02446 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP4Q02446 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP4Q02446 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP4Q02446 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP4Q02446 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP4Q02446 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP4Q02446 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP4Q02446 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP4Q02446 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP4Q02446 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP4Q02446 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP4Q02446 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP4Q02446 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SP4Q02446 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SP4Q02446 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP4Q02446 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP4Q02446 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP4Q02446 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP4Q02446 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP4Q02446 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP4Q02446 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP4Q02446 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP4Q02446 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP4Q02446 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SP4Q02446 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP4Q02446 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP4Q02446 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SP4Q02446 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP4Q02446 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP4Q02446 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP4Q02446 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP4Q02446 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP4Q02446 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP4Q02446 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP4Q02446 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP4Q02446 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP4Q02446 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP4Q02446 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP4Q02446 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP4Q02446 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP4Q02446 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP4Q02446 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP4Q02446 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP4Q02446 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP4Q02446 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP4Q02446 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP4Q02446 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP4Q02446 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP4Q02446 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP4Q02446 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP4Q02446 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP4Q02446 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP4Q02446 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP4Q02446 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP4Q02446 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SP4Q02446 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SP4Q02446 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP4Q02446 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP4Q02446 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP4Q02446 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP4Q02446 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP4Q02446 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms