Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLCB3Q01970 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLCB3Q01970 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms