Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPIBQ01892 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPIBQ01892 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms