Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DEFA6Q01524 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DEFA6Q01524 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms