Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TFAMQ00059 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TFAMQ00059 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms