Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD1P98174 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD1P98174 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD1P98174 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD1P98174 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD1P98174 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD1P98174 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD1P98174 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD1P98174 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD1P98174 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD1P98174 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD1P98174 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD1P98174 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD1P98174 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD1P98174 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD1P98174 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD1P98174 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGD1P98174 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGD1P98174 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FGD1P98174 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGD1P98174 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FGD1P98174 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FGD1P98174 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD1P98174 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD1P98174 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD1P98174 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD1P98174 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD1P98174 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD1P98174 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGD1P98174 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD1P98174 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD1P98174 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD1P98174 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD1P98174 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD1P98174 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD1P98174 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD1P98174 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD1P98174 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD1P98174 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD1P98174 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD1P98174 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGD1P98174 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD1P98174 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD1P98174 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD1P98174 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD1P98174 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD1P98174 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD1P98174 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD1P98174 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD1P98174 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD1P98174 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD1P98174 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD1P98174 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD1P98174 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGD1P98174 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD1P98174 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD1P98174 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD1P98174 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD1P98174 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGD1P98174 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD1P98174 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD1P98174 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD1P98174 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD1P98174 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD1P98174 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD1P98174 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD1P98174 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD1P98174 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD1P98174 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD1P98174 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGD1P98174 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD1P98174 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD1P98174 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD1P98174 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD1P98174 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD1P98174 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD1P98174 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD1P98174 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGD1P98174 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGD1P98174 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGD1P98174 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGD1P98174 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGD1P98174 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FGD1P98174 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FGD1P98174 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FGD1P98174 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FGD1P98174 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FGD1P98174 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FGD1P98174 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGD1P98174 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGD1P98174 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGD1P98174 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGD1P98174 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGD1P98174 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FGD1P98174 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGD1P98174 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGD1P98174 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGD1P98174 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD1P98174 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGD1P98174 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms