Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VLDLRP98155 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VLDLRP98155 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms