Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP5P82980 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP5P82980 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBP5P82980 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP5P82980 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP5P82980 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP5P82980 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP5P82980 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP5P82980 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP5P82980 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP5P82980 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP5P82980 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP5P82980 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP5P82980 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP5P82980 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP5P82980 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP5P82980 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP5P82980 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP5P82980 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP5P82980 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP5P82980 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP5P82980 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP5P82980 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP5P82980 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP5P82980 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP5P82980 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP5P82980 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP5P82980 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP5P82980 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP5P82980 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP5P82980 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP5P82980 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP5P82980 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP5P82980 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP5P82980 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP5P82980 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP5P82980 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP5P82980 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP5P82980 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP5P82980 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP5P82980 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP5P82980 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP5P82980 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP5P82980 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP5P82980 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP5P82980 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP5P82980 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBP5P82980 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP5P82980 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP5P82980 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP5P82980 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP5P82980 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP5P82980 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP5P82980 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP5P82980 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP5P82980 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP5P82980 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP5P82980 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBP5P82980 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP5P82980 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP5P82980 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP5P82980 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP5P82980 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP5P82980 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP5P82980 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP5P82980 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP5P82980 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBP5P82980 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBP5P82980 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBP5P82980 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBP5P82980 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP5P82980 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP5P82980 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP5P82980 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP5P82980 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP5P82980 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP5P82980 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP5P82980 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP5P82980 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP5P82980 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBP5P82980 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP5P82980 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP5P82980 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP5P82980 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP5P82980 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP5P82980 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP5P82980 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP5P82980 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP5P82980 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP5P82980 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP5P82980 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBP5P82980 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP5P82980 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP5P82980 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP5P82980 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP5P82980 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP5P82980 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP5P82980 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP5P82980 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBP5P82980 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms