Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IRX6P78412 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX6P78412 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX6P78412 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX6P78412 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX6P78412 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX6P78412 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX6P78412 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IRX6P78412 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRX6P78412 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRX6P78412 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRX6P78412 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IRX6P78412 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX6P78412 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX6P78412 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX6P78412 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX6P78412 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX6P78412 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX6P78412 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX6P78412 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX6P78412 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX6P78412 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX6P78412 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX6P78412 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX6P78412 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IRX6P78412 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX6P78412 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX6P78412 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX6P78412 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX6P78412 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX6P78412 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX6P78412 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX6P78412 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX6P78412 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRX6P78412 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRX6P78412 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX6P78412 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX6P78412 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX6P78412 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX6P78412 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX6P78412 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX6P78412 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX6P78412 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX6P78412 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX6P78412 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IRX6P78412 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX6P78412 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX6P78412 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX6P78412 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX6P78412 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX6P78412 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IRX6P78412 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IRX6P78412 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IRX6P78412 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX6P78412 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX6P78412 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX6P78412 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX6P78412 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX6P78412 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX6P78412 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX6P78412 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX6P78412 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX6P78412 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX6P78412 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX6P78412 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX6P78412 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRX6P78412 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX6P78412 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX6P78412 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX6P78412 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX6P78412 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX6P78412 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX6P78412 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX6P78412 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX6P78412 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IRX6P78412 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX6P78412 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX6P78412 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX6P78412 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX6P78412 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX6P78412 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX6P78412 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX6P78412 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IRX6P78412 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms