Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEP78395 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms