Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC1P78348 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms