Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITX1P78337 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITX1P78337 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX1P78337 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX1P78337 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX1P78337 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX1P78337 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX1P78337 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX1P78337 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX1P78337 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX1P78337 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITX1P78337 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITX1P78337 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITX1P78337 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PITX1P78337 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITX1P78337 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITX1P78337 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PITX1P78337 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITX1P78337 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITX1P78337 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX1P78337 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX1P78337 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX1P78337 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX1P78337 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX1P78337 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX1P78337 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX1P78337 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX1P78337 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX1P78337 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX1P78337 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX1P78337 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITX1P78337 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITX1P78337 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX1P78337 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX1P78337 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX1P78337 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX1P78337 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX1P78337 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX1P78337 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX1P78337 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX1P78337 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX1P78337 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX1P78337 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITX1P78337 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITX1P78337 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITX1P78337 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITX1P78337 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PITX1P78337 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITX1P78337 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PITX1P78337 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PITX1P78337 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITX1P78337 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITX1P78337 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITX1P78337 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PITX1P78337 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITX1P78337 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITX1P78337 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITX1P78337 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITX1P78337 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITX1P78337 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITX1P78337 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PITX1P78337 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX1P78337 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX1P78337 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX1P78337 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX1P78337 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX1P78337 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX1P78337 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX1P78337 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX1P78337 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms